其實高鐵還有一個問題，就是中部沿線行經的彰化溪州，雲林虎尾、還有土庫這些地方都是有嚴重的地層下陷問題，對高鐵行車安全，是一大隱憂。如今、預定在今年七月通車的彰化跟雲林新站，雖然政府已經逐步查封了沿線的深水井，禁止抽取地下水，不過由於高鐵沿線周邊三公里之內的新建物，沒有加以管制，還是令人擔心。

這裡是新建的彰化高鐵站，施工接近尾聲，一旦完成驗收，民國104年就可通車。不過根據水利署資料，高鐵彰化雲林路段，或是雲林虎尾的新站體都是地層下陷區。

==台灣生態學會雲林工作站 主任 陳清圳==
萬一它兩個基樁之間
下降的速率不對等
就會產生脫軌的問題

減緩地層下陷衝擊，高鐵進行展柱支承墊的調整工程，而檢討原因，高鐵沿線的水井，被認為是地盤沉陷的主因。

==雲林土庫農民 林銘地==
為什麼現在每個農民都要打井
就是因為水沒供應到我們這邊

為救高鐵，政府封水利會和自來水的深水井，卻忽略了高鐵沿線的建物管制。溪州鄉民抗議當地「彰南產業園區」的開發，將加劇溪州鄉的地層下陷，危及鄰近高鐵行車安全。

==彰化縣環境保護聯盟 總幹事 施月英==
依法劃設的話
（溪州)它是屬於
嚴重地層下陷管制區
依法是不能引進
那些高耗水產業進來

==前政務委員兼公共工程會 主委 李鴻源==
（高鐵特定區)不是不要開發
你要開發可以
你要用輕質骨材
你的建築料都要管制

挽救高鐵下陷，民間團體認為，工業用的深水井得先全面清查。未來審核新工廠的設立，也要把水源納入考量，不要再讓工業區設置在地層下陷嚴重的區域。

記者 錢志偉 葉鎮中 採訪報導